在计划经济条件下，药品流通遵循一级站、二级站、三级站的纵向调拨模式，随着市场经济的发展，我们国家医药流通体制改革相对滞后，医药商品作为“特殊商品”迟迟未能建立完善的流通和市场竞争机制。全国现有药品批发企业1.6万多家，而年营业额超过2000万元的不足400家。医药流通企业1999年平均利润不到1%，而销售成本却高达12%以上。2000年医药商业全行业出现亏损，原有的商业站经营网络中许多单位亏损严重，丧失自我发展能力。

　　另外，近年来，受地方保护主义和利益驱动的影响，一些地方药品市场秩序比较混乱，部分地区开办或变相开办各种药品集贸市场，并已逐步形成了一些具有较大影响力和辐射力的药品集贸市场，集贸市场中假劣药品屡禁不止，虽经多次整顿但往往死灰复燃。另一方面，原国有商业由于经济效益不佳，纷纷采取承包经营、挂靠经营、出赁经营等各种经营方式，正如鲁抗集团章建辉总经理在《第三只眼睛看药品流通》一文中指出的，医药流通的商业主渠道，单纯靠吃药品差价，在市场竞争中，由化整为零，到出租证照，最后遭受四面包围，其市场空间越来越小，经济效益越来越差，最后走向死亡是必然的，只有通过炼狱和涅磐，产生一批有生气、有竞争的医药商业企业，医药购销市场才能得到净化,医药商业需要重新整合。

　　对于非法药品集贸市场的问题，国家已痛下杀手，99年，国家药品监督管理局、国家工商局、公安部、监察部四部门联合发出紧急通知，严禁各地开办或变相开办药品集贸市场，现有的非法药品集贸市场要坚决予以取缔。　　

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